G-Force定下了新的对G方法，名叫T计划。由大久保博士提出，内容是利用心灵感应控制哥斯拉，然後利用新发明能分开攻击的新莫基拉消灭哥斯拉，而同一时间有一只和哥斯拉一样拥有G细胞的宇宙怪兽太空哥斯拉正从太空飞来准备袭击地球，原来在1992年摩斯拉一役後，摩斯拉飞上太空时连同G细胞一同带往太空并和一些不知名物质结合後形成太空哥斯拉。人类到底能否逃过哥斯拉及太空哥斯拉的危机……...

1954年9月，一艘往来于青森和函馆的客轮在海上沉没，大批的乘客遇难。阿久津是青函隧道技术调查团的成员，正在津轻海峡进行调查，偶然地救了一个想自杀的女孩牧村多惠，并将他带到阿连经营的食品店工作。1956年，阿久津向上级汇报，认为青函隧道可以挖掘。第二年他被派往明石海峡调查，在故乡结婚生子。1964年，日本铁路公司成立，青函隧道开始动工，阿久津也来到青森。由于多惠的帮助，他招了一批立志为青函隧道献身...

　　G-Force定下了新的对G方法，名叫T计划。由大久保博士提出，内容是利用心灵感应控制哥斯拉，然後利用新发明能分开攻击的新莫基拉消灭哥斯拉，而同一时间有一只和哥斯拉一样拥有G细胞的宇宙怪兽太空哥斯拉正从太空飞来准备袭击地球，原来在1992年摩斯拉一役後，摩斯拉飞上太空时连同G细胞一同带往太空并和一些不知名物质结合後形成太空哥斯拉。人类到底能否逃过哥斯拉及太空哥斯拉的危机……...